Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms