Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC19A1P41440 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC19A1P41440 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms