Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5C1P36542 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms