Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM5AP29375 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms