Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTX3P26022 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTX3P26022 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTX3P26022 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTX3P26022 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTX3P26022 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTX3P26022 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms