Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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