Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms