Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PTPREP23469 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPREP23469 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPREP23469 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPREP23469 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPREP23469 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPREP23469 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPREP23469 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPREP23469 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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