Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RPS6KB1P23443 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RPS6KB1P23443 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RPS6KB1P23443 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RPS6KB1P23443 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPS6KB1P23443 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPS6KB1P23443 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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