Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGB6P18564 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGB6P18564 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGB6P18564 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGB6P18564 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGB6P18564 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGB6P18564 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGB6P18564 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGB6P18564 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGB6P18564 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGB6P18564 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGB6P18564 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms