Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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