Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP3P12645 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP3P12645 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms