Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms