Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMDP11532 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DMDP11532 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DMDP11532 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DMDP11532 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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