Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOP08100 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOP08100 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms