Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOA4P06727 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOA4P06727 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOA4P06727 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOA4P06727 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms