Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APODP05090 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APODP05090 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APODP05090 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms