Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSF2P04141 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms