Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE6O95741 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms