Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POP4O95707 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POP4O95707 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POP4O95707 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POP4O95707 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms