Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DENRO43583 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DENRO43583 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DENRO43583 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DENRO43583 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DENRO43583 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DENRO43583 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DENRO43583 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DENRO43583 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DENRO43583 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DENRO43583 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DENRO43583 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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