Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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HOXA3O43365 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HOXA3O43365 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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