Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CTDSP2O14595 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms