Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms