Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms