Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms