Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
MAP3K4Q9Y6R4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP3K4Q9Y6R4 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms