Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YBX2Q9Y2T7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms