Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PADI4Q9UM07 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms