Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNAL1Q9UBT7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms