Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF7Q9UBF6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms