Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms