Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIN1Q9NXP7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms