Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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