Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XAB2Q9HCS7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XAB2Q9HCS7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XAB2Q9HCS7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XAB2Q9HCS7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XAB2Q9HCS7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XAB2Q9HCS7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms