Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC3GQ9HC16 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms