Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM27Q9HBJ8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 366.9 ms