Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL4Q9C0H6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL4Q9C0H6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms