Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FOXQ1Q9C009 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXQ1Q9C009 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXQ1Q9C009 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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