Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms