Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM79Q9BSE2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms