Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FYCO1Q9BQS8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms