Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDRT15Q96T59 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDRT15Q96T59 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDRT15Q96T59 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDRT15Q96T59 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CDRT15Q96T59 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDRT15Q96T59 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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