Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms