Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK4Q96L34 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms