Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZC2HC1AQ96GY0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms