Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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ECHDC3Q96DC8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ECHDC3Q96DC8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHDC3Q96DC8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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