Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms