Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNDC1Q96C34 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms