Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms